English version of this page

Oslo Bioinformatics Workshop Week - Effektivisering av genomikk med NVIDIA Parabricks

Den 12. desember 2024 arrangerte NAIC et praktisk kurs med tittelen "Akselerering av genomiske arbeidsflyter på GPUer: Hands-on med NVIDIA Parabricks" som en del av Oslo Bioinformatics Workshop Week.

Kurset ble introdusert av Sabry Razick, som presenterte NAIC og prosjektets mål. Pubudu Saneth Samarakoon var hovedinstruktør og ledet deltakerne gjennom bruken av GPU-akselererte verktøy for genomikk. Ashen Wijesiri bidro som teknisk assistent, og sørget for GPU-ressurser og hjelp med tekniske utfordringer under den praktiske økten.

Kurset ga deltakerne en introduksjon til NVIDIA Parabricks, en programvarepakke som effektiviserer NGS (neste generasjons sekvensering)-analyse. Deltakerne fikk lære hvordan Parabricks kan gi betydelig reduserte prosesseringstider for oppgaver som variantdeteksjon i kimbanen, samtidig som høy nøyaktighet opprettholdes.

Den praktiske delen var høydepunktet, der deltakerne fikk prøve verktøyene selv og se hvordan de kan forbedre sine arbeidsflyter. Kurset ble avsluttet med en diskusjon om fordelene og utfordringene ved bruk av GPU-baserte løsninger innen genomikk.

Arrangementet var svært lærerikt og ga deltakerne både innsikt og praktiske ferdigheter for å effektivisere sitt arbeid innen genomikk.
 

Publisert 17. des. 2024 10:36 - Sist endret 17. des. 2024 10:39